Google醫療AI工具DeepVariant走上云端
由Google Brain與Verily Life Sciences打造,用來提高基因組測序準確性的工具DeepVariant,現在可以透過Google云端平臺(Google Cloud Platform;GCP)取得, 為DeepVariant的普及應用目標奠定基礎。
本文引用地址:http://www.104case.com/article/201712/373145.htm據Healthcare IT News報導,開發團隊在Google云端平臺上部署開源版本的DeepVariant,并采用可擴展的Pipelines API,優化成本和達到快速周轉的目的。 為用戶在當前的運算環境中探索和評估DeepVariant的功能,同時提供云端解決方案,滿足基因組龐大數據集的需求。
DeepVariant透過高通量測序的準確性,解決精密醫學當前面臨的最大挑戰之一。 開發人員DePristo與Poplin表示,30億堿基對基因組中只有100個基因,每個堿基的錯誤率在0.1~10%之間,所有配對的堿基被組織成23對染色體。
為了構建DeepVariant,Google Brain團隊首先從GIAB(Genome in a Bottle Consortium)組織的參考基因組開始,創建數千萬個編碼高通量測序數據的示例。 下一步是培訓Google TensorFlow分類模型來區分真正的基因組和實驗數據。
2016年DeepVariant在美國食品藥品監督管理局(FDA)發起的PrecisionFDA Truth Challenge競賽中拿到第一名,從那時起Google就將DeepVariant錯誤率降低50%以上。
微軟(Microsoft)與匹茲堡大學醫學中心合作發展人工智能(AI)并發布新產品包括HealthVault Insights、Microsoft Genomics、聊天機器人與Project InnerEye之后, 于2017年9月在英國成立專注醫療保健的人工智能實驗室。
而IBM Watson自2015年收購Phytel和Explorys以來,一直專注在醫療保健人工智能,并為超級計算機的產品組合添加華生基因體學方案Watson for Genomic和腫瘤解決方案Watson for Oncology。
Google的目標是將技術應用在醫療保線與其他科學應用上,最終讓工具與數據提供給更多人使用。 DeepVariant是利用Google的運算能力和機器學習來理解基因組,并為社群提供更深入基于學習的基因組學工具。
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