解析基因巨頭如何壟斷全球測序儀器市場七成份額
去年2月,公司再次宣布了另一項戰略合作。Illumina與10x Genomics簽署了一項合作營銷協議,以推廣10x Genomics的Linked-Read測序產品和Illumina測序系統。不僅如此,雙方還將就長鏈閱讀應用的開發展開合作,共建產業生態。
本文引用地址:http://www.104case.com/article/201703/344912.htm10x是2015年摩根大會的一匹黑馬,公司的GemCode平臺,一經推出就引起業界廣泛關注。此次合作,10x 將利用Gemcode技術為HiSeq X、HiSeq、Nextseq、和Miseq的用戶升級現有系統,提供相比于市面上其他的長讀長系統可以以更低的成本和更高的質量服務。
除了頻頻合作以外,Illumina 還在去年4月斥資1億成立了風投基金Illumina Venture。基金將由Illumina前法人兼戰略發展高級副總裁Nicholas Naclerio掌權,投資目標為專注“通過釋放基因組力量改善人類健康”的創業公司,這也符合Illumina自身的核心價值觀。
基金的成立標志著Illumina在中游市場地位的穩固,也或將成為直接通過公司投資和培育其他公司拓展基因組學產業生態的最后嘗試。
除了以上的商務戰略性合作,公司還在2016年12月年啟動了公益性計劃iHope,致力為不明病因且無法支付測序診斷費用的兒童提供幫助。Illumina計劃在2017年對100名患者及其父母進行測序。
Illumina將在其CLIA認證和CAP認證的實驗室免費為所選個體進行臨床全基因組測序,一方面可以為患者提供人道主義上的幫助,另一方面也可以作為醫療實踐的一部分,加深自己對罕見疾病的認識。
下游:數據+云服務
Illumina 致力于為基因組學提供最完整的解決方案。2012年,公司推出了測序云計算平臺——BaseSpace進軍下游市場。早年間,公司收購了NextBio、GenoLogics等基因組信息學領先企業,不斷擴展企業信息學業務。幾年來也是頻頻合作,擴大其在下游市場的影響力。
2月份,Illumina簽署了多項生物樣本庫協議,其中包括范德堡大學和科羅拉多大學安舒茨醫學院、聯盟醫療以及蒙特利爾心臟病研究所。
Illumina的執行副總裁兼首席商務官Christian Henry表示:“這是四個漸進個性化醫療項目,說明了利用多個遺傳分析與鑒定方案,基因組學正大力推動對人類生物學的理解。”
根據協議,這些高校及醫療機構將利用Illumina的技術對存放的大型樣本集合進行基因分析,通過基因組信息與電子病歷和臨床信息結合,從而推進個性化醫療,改善人類健康。
除了樣本庫協議,公司還與Genomics England達成伙伴關系,開發平臺和知識庫,推進使基因組解讀的自動化,以緩解規模日益龐大的數據帶來的解讀壓力。
根據合作條款,Illumina將開發解釋和報告工具,讓通過10萬人基因組計劃測序的所有基因組都能提供報告。這些工具將在Genomics England的安全數據庫中運行,讓研究人員和臨床醫生能更輕松地訪問信息和報告。
Genomics England將獲取全基因組序列和不包含識別信息的表型數據,讓這套工具用于個性化醫療。這些工具將用于管理計劃開展過程中產生的信息知識庫,其重點在罕見病和常見癌癥。
Illumina和Genomics England已經同意,將10萬人基因組計劃中獲得的臨床發現提供給通過合作開發的工具的批準用戶。Genomics England將與Illumina合作開發一套信息學工具,這將為NHS基因組醫學中心和Genomics England為臨床和科研的大規模研究提供支持。
此次合作還允許Genomics England在數據獲取和基因組數據管理上使用Illumina其他工具(NextBio?和baseSpace?)。Illumina將為Genomics England的研究人員和GENE聯盟提供10萬人基因組計劃的部分數據集,作為NextBio?Clinical的試點項目,這將讓人們對不包含識別信息的基因組中的復雜表型和基因型信息進行隊列分析。
4月,公司推出了第一個從樣本到解讀的云端信息學架構BaseSpace? Informatics Suite,再次拉近了與精準醫學的距離。
BaseSpace Suite是目前最完整的基因組學工具和解決方案,為用戶提供了一個統一且綜合的平臺,可實現實驗室信息管理、分析和共享,以及樣本解讀、報告和前沿分析。
BaseSpace Suite縮短了從樣品提交到獲得答案的時間,解決了基因組數據處理和分析中的關鍵問題。當然,更重要的是用戶無需整合多個供應商的單點解決方案,這對于整體結果的準確性而言意義重大。
在后來與梅奧診所的合作中,BaseSpace? Suite發揮了巨大作用。作為協議的一部分,梅奧醫院將會在具體的幾個實驗室中使用BaseSpace Clarity LIMS以檢測該工具。BaseSpace Clarity LIMS是一個在實驗室中提供整體工作流程追蹤與整合的系統。梅奧醫院也會部署并提供其使用BaseSpace Sequence Hub和BaseSpace Variant Interpreter的反饋信息。
BaseSpace Sequence Hub是一個用于數據分析與管理的云基因組計算環境。BaseSpace Variant Interpreter則是一個用于節約從基因組數據中獲取生物學信息所花時間和精力的云解讀平臺。這個軟件解決方案將會由梅奧醫院進行試驗,來注釋并解讀基因變異在疾病發展過程中的潛在作用。
憑借合作伙伴關系,梅奧診所得以優先使用新一代測序技術;Illumina將會獲得經驗和信息用于現有的產品開發。
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