FPGA在實時基因組測序計算大顯身手，把測序時間從30小時縮短到26分鐘！

　　基因組測序是一種新型基因檢測技術，它可以從血液或者唾液中分析測定基因全序列，用來預測疾病，個人的行為特征等等。實現這一項技術需要海量的計算支持，常常需要等待一段時間才可以獲得檢測結果。然而，Edico Genome推出的“龍”硬件加速卡將測序計算時間由30小時縮短到26分鐘，很快就可能優化實現實時計算的目標。

　　IBM Power Systems最近在《華盛頓郵報》官網上發表了題為“Powerful computing crunches genomic data at warp speed”的文章，文章描述了Edico Genome使用硬件加速器來加速基因研究的海量計算。Edico Genome董事長兼CEO Pieter van Rooyen和他的團隊在南非進行血液分析的工作，主要面向兩種疾病：艾滋病(HIV)和肺結核(tuberculosis)。同時他們也開發了一款定制的硬件加速卡來加速計算，這款加速卡就是“龍”卡，卡上集成了基于IBM Power8處理器的S822LC高性能計算服務器和Xilinx 28nm FPGA。

　　加速卡計算的效果如何呢?“之前一個基因組測序需要大約30小時” van Rooyen說，“我們已經把計算時間降到26分鐘，很快，我們就會進一步優化到10分鐘”。他預計一個全序列基因編譯可以在接近實時的時間內完成。